La temprana formulación del Atlas Etnográfico de Vasconia requirió la formación de unos equipos de investigación, denominados Etniker, distribuidos por toda Euskal Herria. El propio Barandiaran se encargó de organizarlos en los distintos territorios en los primeros años de la década de los setenta del pasado siglo XX.
- Etniker-Navarra: Se creó en 1969, como complemento de la Cátedra de Etnología Vasca que regentaba D. José Miguel de Barandiaran en la Universidad de Navarra. Sus primeras investigaciones como monografía etnográficas de las localidades encuestadas comenzaron a publicarse en Cuadernos de Etnología y Etnografía de Navarra a partir de ese mismo año.
- Etniker-Gipuzkoa: Desde 1954 Barandiaran venía dirigiendo en San Sebastián un Seminario de Etnología al amparo de la Sociedad de Ciencias Naturales Aranzadi. En 1972 comenzaron los primeros intentos para formar un grupo de trabajo para el proyecto Etniker. Este grupo como Etniker Gipuzkoa se formalizó en Ataun en 1974.
- Etniker-Álava: Los primeros intentos de la formación de este grupo fueron en la Sociedad Excursionista Iradier de Vitoria en 1971. En 1973 se estableció un grupo de investigación en la Sección de Etnología del Consejo de Cultura de la Diputación Foral de Álava. Posteriormente los componentes del Grupo Etniker Álava formaron el Seminario Alavés de Etnografía y crearon la revista Ohitura donde se han ido publicando el resultado de sus investigaciones referentes en Álava.
- Etniker-Bizkaia: Tras un primer intento en Euskal Kultur Mintegia de la Universidad de Deusto, Etniker Bizkaia se inició en la Biblioteca Vasca del Seminario Diocesano de Derio, donde D. José Miguel de Barandiaran expuso el proyecto de investigación en mayo de 1972. El 10 de julio de este mismo año quedó constituido como tal el grupo con la firma de Barandiaran en Axlor-Dima. En 1975 comenzaron a publicar un boletín interno con el nombre de Etniker Bizkaia.
Por lo tanto a mediados de los años setenta el plan de investigación Etniker ya estaba en marcha en todos los territorios de Vasconia peninsular.
Más tardíamente, en 1986, miembros de la Association Lauburu de Baiona formaron el Grupo Etniker-Iparralde. Varios miembros de la Asociación venían trabajando en temas etnográficos y se adhirieron al proyecto del Atlas Etnográfico.
En 1976 tuvo lugar en el Santuario de Aralar la primera reunión conjunta de los Grupos Etniker, reunión que se ha repetido anualmente hasta el día de hoy organizada rotatoriamente por cada uno de los grupos y celebrada en su territorio.